RF-DYMHC
An Random Forest-based System for Detecting
Yeast Meiotic Recombination Hotspots and Coldspots
Introduction
In the yeast, meiotic recombination is
initiated by double-strand DNA breaks (DSBs). Meiotic DSBs occur at relatively
high frequencies in some genomic regions which are called hotspots while the
regions associated with low frequencies of DSBs are called coldspots. We present
a random forest (RF) model to detect the yeast meiotic recombination hotspots
and coldspots from genome sequences.
Input
Users can enter a sequence (from 5'->3' direction) in Fasta format only. The method provides the option of pasting the
sequence in the text area or uploading the direct sequence file. All
non-standard characters except the four nucleotides bases adenine,
guanine, cytosine and thymine will be ignored from the sequence. The method
only allows the prediction for single sequence in one run of prediction.
Although there is no limit size for input sequence, we highly recommend users to
upload rather than paste the sequence to server if the sequence length over
500kb. The reason is that some browsers have size limits in pasting data.
Parameter
selection
Scan window size
Users can define a window size of your
input sequence. The non-overlapping sliding window will scan the sequence.
Reliability index
The reliability index (RI) is used to
determine the effectiveness of recombination hotspots and coldspots prediction.
For RF algorithm, an intuitive RI can be derived by the fractions of votes for
the positive and negative classes of each sample. We define RI as:
RI=INTEGER (|F+-F-|
*10)
where F+ and F-
are fractions of votes for the positive and negative classes of each sample,
respectively. The predicted hotspots and coldspots have more possibility to be
'true' hotspots or coldspots with a higher RI value. Therefore, RI as a
regularization parameter controls the trade-off between sensitivity and the
specificity.
Output
The results are shown in a user-friendly
format. It provides the number and position of hot/cold spots.
An output example:
The length of
your sequence is 72779 bp, the scan window is 0.5 KB, and RI is
>=6.
10 Hotspots and
13 Coldspots have been detected.
The Sequence Marked in
Color
Red:
Hotspots,
Blue: Coldspots 1:TGCTAAACTGCAGCTTGACGTACTGCGGACCCTGCAGTCCAGCGCTCGTCATGGAACGCAAACGCTGAAAAACTCCAACTTTCTCGAGCGCTTCCACAAAGACCGTATCGTCTTTTGCCTCCCATTCTTCCCGGCACTTTTTCTCGTCCCAGTTCAAAAAGTACTGCAGCACCTCTGTCTTCGATTCACGCAAGTTGCTCCATACTTTATAATACAACTCTTTGATCTGCCTTCCAGACATGCGGAAAACTTGGCTCCCTTGCTTGCCTCTTGTCGAATCCAATACACTAATTGTTTCTCTTCTTCTAGTAATGGCCAGGTACCAAGCATAATTTCTCTGTATCTGAGAGTAGATCTCTCCCCTTTTTACGCTAAAAAATTTCAAATACCCTACAGGGTCCCCATGATATGGCTCGATGTCTTCCAAGTATTCTTTGTATTCCTCGTCATTTCGCAGCATTCTCTCCACAGCTAGTGCTTCCCAAGCCATCCTCCGATAC
501:GATACTTTCTGGCCAGCCCAACAGACACAGAGCTCGAACATCTTTTGACAGCCCTTGCATAATCCGTATTGTGTGAATACTCCCTCTGGGCAGAAGTATACGTCAATACCATAGAGGAAAAGATGTTTAATTTCGTCAGACCGAAATCCAAGAAACTGTAAGACATTCATATTCTCGGAAGTATTGGGAAATTGTGCTTTCAGTTTCTTTCTCTCTAGCAAAACCATTTGACTCCCTTTCCGCTTATACGACTCTTTGTTAATGTCGGTGACTGGATGGAATCTATTATCCTCAGCATTGCCATCTTTATTGGCGTCCTCCTTGGCACTAGCGTTGGTGCTGGCAGTGGTAGTAGCATTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTCGCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTCGCATTAGTGCTGGAGTTGGTACTTTCAGTGGTAGTAGCACTAGTCCTGACGTTGATGCTGGCAGTGGTAGTAGC
1001:ACTAGTCCTGACGTTGGTGCTGGCAGTGGTAGTAGCATTAGTGCTGGAGTTGGTAGTCGCATTGGTACTGGCATTGGTAGTCGCATTGGTACTGGCATTGGTACTGGCATTGGTAGTCGCATTAGTACTAGCATTGGTAGTCGCATTAGTCCTGACGTTGGTACTAGCAGTGGTAATCGCATTAGTACTGGCGTTAGTACTGGCATTAGCACTACCATGAATGCACGTGTCGCTGTCCTCATCACTGCTGCAATACTTTCTGCACCTGTCACTGCTATTGCTCTCCTGGAAGCTAGACGGTAACGCAACGATCGACATGGAAGCTGTCGCCTGTTTTTCAGCCAATCTGTCCATTCTTTCTATCAGTTCCACTGTGTCAGCAGACACAGCATCCAACATGCTGGCCCTTTTTTCCTTTCTTTGATTCAAGTCCATAGAACTCGCGTACCTGTTCGGTTATACAGCCTTCCTTAATTGGTGGTAATTCACCCTTACGATTC
1501:CTTGCCGCCCAACTGTTTTTTCTAGATAATAGATAACAGAGGCCCCCATCTCTTAGTCTCCCTACACCTTGAATGAGCTCAATAATATTAAGTCTATTATCAAGCATGATCACCATCATCAATTGCTTAATGTCAATTCCTTCAGTCACTAATTTCGTTCCGATGAGAACTTGCATGCTACCGTCAGTGACAAACTCCTTTGTGCGAGACACCTTTTCTGCAGCACCCAGCTTCCCGTGTATCCATACCACCCTAAAATACTTTCTCCAAGAGCAGGCCAATTCTTCCACTTCGTTGGTTGTGCTTGCAACTACAATGGCCTTCGACTCTGGTTCAATTTCAAAGAGGGCTAAAAGAAGCTTCAGTGCTTCTTCGGGCTGTGATTCCACTTTCTTCCAAATTTTATGAACATGCCCTAAAGGCACCTCGGATTTCTCCTTGATTAGATTAAACATCCGTGTTGGATAGCTGGATAGACCTCTGCTGAGATCTTCCGACCG
2001:TTTGAGCTCGTTGATGTCCATCGACTTCTTGGCCAGTCCCGTAAGCCCAATACGCTGCAACGCAGCATCAGCTACAGCCTCAGGGGCTGTGCCGCTCAAAAAGATTGCTTTCTCAAAAGCGTCAAAATCAAGGTTAGTTATGCCCCCAAATTGCGACTGCCGGTAGACCTCCGTTTCAAAGTTGTGAAACTCATCTACAATGAGGTAACCCAATTTTACGTTGTTGGTCCTAAAGGTGCACTCAACAATATTCTCCCACGCAGCTATCCTGTCTGTGAAATTAGTGCTAGCAAGATCATCGTAGATCCCCACGTATAAATCAGTAACGCCATCGTAACCTTCTTCAATAAAGTTTCTTACAGGGGCCACATTCAAGCAACCGCGTCGGCCCAACCTGATCATGCAATTAGCAAGCAACACTGTGTACGGTACAAACAGAAACGACACATATTTCACGTCGCCCTTAGACGCCAGTGCTATCAAGGGGAGATGAAATAACT
2501:CCGTCTTACCATAGCCCGGTGGGGCCTGTACTGCCACAGAGGGTGTGTCTGCCATGTATATTTCATGACATAAGCGCAACTGATGCAAGTCCCTGAATTCAAAGGAGCTGCCAAAGAGTTTCTGGCCTGCGACGAGGATATCGTTTGTACTCTTGGGCTCTCGGGGCCTTTTTCGCGTTACTCTTGAAATTTTTTGATCATGATCTGAACTCGCCGCCTCACCTGCCACTACGTCTTCCGCATTCCGAGTACTAGAGAATGAACAATGGTAGTCGCTTTCAAGGCCTAACCATTGAATCCAGCGCTCGGAAGTGAGTCCGTCAAGCGTCTTTAGTCGAGGCTCCGATGAACCGTTCTTGTTGTATCGTCGACGTATACGTTGCGCTGTAGCTCTGGATAACGGTAAGCGTATCACCGTAAGCTCGTCAATTATTTTTGAGAGCCGCGGTCATTTTGTTAGTATCTCTTCTCAACTTGGGCAGCACACACGCAAAACATCA
3001:CCCAATCGGTCCTTTTTGTTCATCATATCGTTACATATCTGTGAAAAGTACTTTATCTCAATGGGTTTACGTGGGCATAGATCACGCTTCAGCCGCTCTGTGTCGACTTTCTTTTCGCCAGGTAAACTTGCTTGGTATGCAGAAAAAATCGATAGCTCATCTACGTGTAGTAACAAAAACATGTGGGGTGCCAAATTGTACCCATATTTCCTTATGGTGCTTTTCTGAAGACTCCTTACAATAGGTGCGCCAGAAACAAAGTCAGTGAAAGTACGCATCGTAGAGCTGTCGTTCGGCCTGGCACTCGCTATTTCGTGACAACGTTCCAGGACACGGAAAACTCAACTCATTATAGTATCCTCTGTTGAGGTAAAAAAGAGAAAGGGTATCGTAATCCTTTCTATTGAATTTCAAAGTATGCACTTGAAACAACGTGTAGACCATCAAGTTGATTTTCTTGGGAATAAGATACTTTGAAGGGATTGGTCCGCCCTGGAAAT
3501:CTGGTTCGTCTTCAACAAATGTCAGGAACTTTTGTACATTTTTCCCGACCATGACGGAAATGACAATTTTTTCAAAAGACCTTTTCCTATTCATTGCACCAGTTCTGAATTTTACCACTTTGATTAGGCCAGACTTTTCGTCTTCGTAGAATGACCGCACTTCCGTGGGGATCGATTCAAATAAAGTTATTGAGGGACAATGTACCAAGTCGTTTTTGTTATTTAGAGCCGACTCAAACTCGTCAAAGTTTGCTTTTTCAAACTTACGCCTATCGGAAACTTTCATTTTATTTTTGTAAGTTTCGAAATTAACAATAGTATGTTGATTGTTATGCTTTTTGACAAGAAATCCATCAATATAAACAAAAGATTGTCCAGTTTCCGTCTTATCATCATCTAAGAATGTAATAATTAAGCTATTGAGAAGATGCAGAATCTGCGCTATGCAGGTGCAAATCTCCAGCAGCAGCAAAGAAAATTCAGTTAATAAGAAATCTCAC
4001:TAAGATAAGCGACTGTCTGTCCCCTTCAAGCACAACATAGAAAACAGAAGGATGTCTCATTCATCGCTTGATTTCCGGCCTGCAAAAATAAAGTAGTCGGTACGCACTTTCGTTTTCAATTTCCATGGTGCACAGTATCTTAACTATCTGCTTAGTCGAGGAGAACCAGGATTCGTGGATATTCTCTTGGATACTTCAAACATGGACCTACGCTTAGCCTGCGCTTAGCCTACAACTTCTTCCGCTCTCGAAAAGACCAATATAATAGAAAGTTATAAATTACATTTCCTTATTAGGTATACGACCTCGCGCTTCGAAGTAGAGGAGCCCTTTTTGGCGTACCTACATATGGCGCGTCAGACAGACAAACTTCCCCCAAAAATGTATTACCCCGCCGAATAAGAAAACAGACCCATTCACCCACGACGTATCAAGTTACTTCCTTGGTGCAATGTCCCACTATAAAAAAATTCCTTGACGCTAGATCGTTGGACTAAAAT
4501:CTGCGTCCCAATCGCCTAAACAGGAAATATTGCCTATTTTCGTACAAGGTTACTTCCTAGATGCTATATGTCCCTACGGCCTTGTCTAACACCATCCAGCATGCAATACAGTGACATATATATACCCACACACCCACACACACCACACCCACACACCCACACCCACACACCACACCCACACCACACCCACACACCACACCCACACCACACCACACCCACACCACACCCACCACACCCACACCCACACACCACACCCACACCCTAATTCTACCTCAACCCTACCCTAATCCAACCCTTCCATCCTGTCTCTCAACTTACCCTCCATTACCCTGCCTCCCCACTCGTTACCCTGCCTCCCCACCACCAACCCACAAATCCACCATAACAGTTACCCTCCAATTACCCATATCCAACCTCACTGCCACTTACCCTGCCATTACCCTACCATCCACCATGTCCTACTCACTGTACTGTTGTTCTACCCTCCATATTGAAACGTT
5001:AACAAATGATCGTAAACAATGCACACATACTTACCCTGCCAATACCCTACCATGCCCCATCTGTCATACTCACCATCACTTGTATACTGATACGGCATACGCACACGGATGCTACAATAGTATATACTATCTCAACTTACCCTACTTTCACATTCCACTCCATGGCCCATCTCTCACTTCATGAGTACAAATGCACCCACATCATTATGCACGGCACTTGCCTCAGCGGTCTATACCCTGTGCCATTTACGCATAACTCCCACTATTATCCACATTTTAATATTTATATCTTATTCCGCGGCCCCAAATATTGTATAAATGCCCTTAATACATACGTTATACCTCTTTTTCACCGTATACTAACCACTCAATTTATATACACTTATGCCAATATTACAAAAAAATCACCACTAAAATCACCTAAACATAAAAATATTCTATCCTTCAACAATAATACATAAACACACTCAATTGCGTATCAATACCACCATGAGGTCATT
5501:AACTTAAATGTTCCTTAATACCGTCATACCACTATGCTCTATTCCATATATTGTAATATAACTGTACTCTATAGTCATACAGACGCTTTTACTTCACCCTATCTTCTCATACTATTGTCATAGAATCGCACACTGACGCATGATTAAAACGAATAATTTTTACTATAAGGCCTCCCATCCGTGCTCTATCCTTTTGTTTGAAACATTTATATACAGAATCTCAAAGCAAGCGGGAGAAGTAGTAATTACCCAGAGGTCATGCATGATCTTAGCACCACCGTACCTCTAAGTTTTGCTTTGAGCCTTTTTACAGTGACATCAAACATAAGGAGAAAAAATGGTATTGAAAGGTTATCAATATAGGGAAATAAATTGGTTCTATGAATCTTCATGTAAGATACTCGTAGGACAGACTCTTTCCTGTGTAAATATTTGTGACAGCTACGTCTATTTTCTATTAGATATTTACACATTTTTGTCACAGGCAATCTACGCTTAAA
6001:ATATACGTTTCATTTTGGGTAACAACTGCTGTGCGAACAGTGACATTGCTGGTCGCACCTTAAATGTAAACCAAAGTTACGGCACACCGTGATGTACCCTCATACAAAGCTTTGTAAAAGTATTATTACGATTATCGAGTAACTTAGATAGAAAACCGGAAATGAAATGGACTCCCTTTTCGAATAGTAGAGTTTCTGTGCCTAAAATAGCCCAACATTGTTGCCCTTTTTCTATCACGAGGTTACTGAGCCATTGCATGAACGCGCGCGCCTCGGCGGCTTTTTTTTCTACTCTATAAAAGCGAAAAGCCAGAAGTTACTATCTCGAATAAAAAACCCCTCGAACTGCCATCTCATTACCGAAAATGAAAGAAAATGAACTTAAAAATGAGAAAAGTGTAGATGTATTATCTTTCAAACAGCTCGAATCTCAAAAGATTGTTCTACCTCAAGATCTTTTCAGAAGCAGCTTTACCTGGTTTTGTTATGAAATTTACAAG
6501:TCCTTAGCGTTTCGCATCTGGATGCTATTATGGCTACCACTTAGCGTCTGGTGGAAGCTTTCCAACAATTGGATTTACCCGCTTATGGTTTCACTTCTTGTCCTGTTTTGGGGACCAGTATTTGTTCTTGTTATTTTTAGACTTTCTCGTAAACGTTCCTTATCGAAACAACTCACTCAGTTTTGCAAAGAGATTACTAAAAGCACACCAAGTTCGGATCCTCATGATTGGGAAGTTGTTGCAGCAAATCTAAATTCGTACTTATATGAAAATAAGGCTTGGAATATTAGGTACTTTTTCTTCAATGCCATGGGCTGCCAAGAAGCGTTCAGAACAACCCTTCTCGAACCCTTCTCTTTGAAAAAAGACGAAGCTGCCAAGGTTAAGTCATTTAAGGATTCCGTCCCTTACATTGAAGAAGCATTGGGAGTTTATTTTAGAGAAGTTGAAAAACAATGGAAGTTGTTTAATTCTGAGAAATCATGGAGCCCTGTTGGCCT
7001:GGAAGATGCTAAACTTCCCAAGGAAGCTTACCGATTTAAGCTTACTTGGTTTTTAAAGAGGATTTCCAATATTTTTATGTTGATACCATTCCTTAATTTTTTGTGCTGCATATATGTGTCACGGGGAATGTGCCTTCTATTACGCACCTTGTATCTCGGGTGGATTCTTTTCATGTTGGTACAAGGTTTCCAAAATATAAGGGTTTTGATTATGAGCATGGAACACAAGATGCAGTTCTTGTCGACTATTATAAATGAGCAAGAAAGTGGTGCGAATGGATGGGACGAAATTGCAAGGAAAATGAATAGGTACTTGTTTGAGAAAAAAGTCTGGAAGAATGAAGAGTTTTTCTTTGACGGGATTGACTGTGAATGGTTTTTTAGCCACTTCTTCTACCGCGTTCTATCTGCGAAGAAATCTATGCGGGCTCTATCATTGAATGTGGAACTATGGCCATATATTAAAGAAGCGCAATTATCCTGCAGTGAGGAGTCCTTAG
7501:CGTAAAGATAAATACAACTTTTTCAATTTATATATTTTGTAGTTTGTCAGCTGCGAATAACCAAAACGAGACTACTTTTTACGATTACAACCATTCTCTTTTTCCCTATTTCTCACTGGTTGACAGAAATCAGTGTGCTATCATCCTACCATATGCGCAAAACTTATTGTCTTTCTCCTCCTAGAGATGCTGTATTCCATGCATATTCTGAACGATGGGTTGGTGTTTTTATCAAGCAAGGTTAATCACATGGCGTGGCTTGCTCCACGCATCAGTAGAAAACGCATACCGCAGCGGAATCCTTAAATAATAAGTGATTTTACTGTTCATCAACTACAATCGGACTCTTTCACAATTACCCTTCTTGTTTTCCACATTTACTGTTAAATGAAGGGATGTACAGAAGGCTTAGGAAAACCTGTGCTGAATACTGGATGGACACTGCATTCCCACAGTGAAGCTTTTATAGATACACTGCCAGTTATTTTCGAACTTTCATC
8001:AAGTTGCTGAGTTTTAGTATCCCTTTGCCTTAGCTATATGTTTGAATGAGCAAAATATTTGCAATGTCTCTAGCTTTCTTGAAATATTGGTTTATATTGAGGGCTTGGTAAGATTTCAAATTTCATTTTGAAGTGCTCAGGAGAAAAATCATGCTCTTTTGATAATTTGGTGACTAAACATACATAAAACAGTTTAATTTTGGGTGGTAATGGCTGTGTGACTAGCTATAGAAAGAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGTAGTTCCTGCACTGCGACGTCCATTATAGCATTATAAATTGGTCCCTGATTTACGCATGCGATAAACTATTTTTAGCGCAGCCGCATATTATCCGAGAATAACTTCCGACATAAGAAAATTCGCAGAAAATAGATAAAAAAACTGCTCTTGGCATTCTTCACTTCCTCTATTACACACTGTGTCATACCACAATCATCTCACAGTATGTATTTGTATGTTTATACATGCTATAA
8501:CGTAAAACAATGTAGAATATATATCTAAATACCTCACGGTTTTAGTTTAGTGCAGCCCACATACTACTTTTTTCCTTTTGTTTTTTTTTTTTATATTTCAAAGGTTAAACTCGCTTAGACTATGTCTATAATATAAAAAAAAAATAGCTCTATTCCGTTTCTTTTATTCTATTTGATATTTCCATCACACTTTCATCTTAATCACGGATGTATACTGATAATAGGGTTGACTGCGCCTGTACGGATTACAGTGCCCTCTTCAATTGGAAAATCCAAGCTTTCAAGATGGGTAACTGTTATTCAAAGGATCCTCTAAGATAAAACACAGATCGACAGATCCGAGAGTTGGCTTCTGTGCCTTGGGCTCAAATTCCTTTCCCACCTCATGCAAATTGATTTTTCTGACTCCAAAAAAAGACAGAGCCCTGCGATAGTTCCCGAATGTTGTAACATCAAAGCCAAGCACTCCTTTATAGAAGTCGCATGAACGTTGAATACTA
9001:GCAGCTGGTGAAACTACAGGGTCTAAACTAACTAGTATCCATATCTTTTTGAGAGCATTGAAAGTATACGGAGTACAAGCTGGGTTAGAAGGAATTTTTATCTTAACAGCAATGAAAATCAACTTTCTAGACTGAATCCCTCAAGAAAATTGCAAAAGACTAACTGATACTGGTTTAAAAGAGAAAGATGTCAAATATGCGGAGTTATACCATCAAACAACTTTGGACGGCCCCGAAACAAATGTCCGCAAAAAAGATCTTATTAAAGTGCATGGACACTATCATTTCTATAATACAAAATACTCCACCGCACAATAGTTTGTCGGGAAGTCATCAATCAATCTTGTACGAGCTTTACAAATAACTTTTTAGGATCGGTCCCCTCATAAAATTATATATAAATGGGTTAGTTTCCTTCTTCTTCTGTTAACATGAAGTTGCTTCGTACTGTTTTTTGCCTTGCTTCTCTTCAAAAGAATCAATCATGTCACAGTACGGAT
9501:TTGTAAGAGTTCCTAGAGAGGTAGAAAAGGCCATTCCAGTGGTGAATGCACCTAGACCACGGGCCGTTGTTCCGCCTCCAAACAGTGAAACTGCTAGGCTTGTTCGGGAATATGCCGCTAAAGAATTGACTGCCCCCGTTCTAAACCACTCTTTGCGTGTTTTTCAATATAGTGTAGCTATCATAAGAGACCAATTTCCAGCATGGGACTTGGATCAGGAAGTTTTGTACGTCACCTGCTTACTTCATGATATTGCAACAACAGATAAGAATATGAGAGCCACGAAGATGTCATTTGAGTATTATGGTGGCATACTTTCAAGGGAGCTTGTATTTAATGCGACAGGTGGAAATCAGGACTATGCAGATGCAGTAACTGAGGCCATCATTCGTCACCAGGATTTGACTGGGACTGGCTACATTACCACCTTGGGGCTCATTCTGCAGATTGCTACTACGCTTGACAATGTCGGATCCAATACCGATCTGATTCATATCGAT
10001:ACAGTTAGTGCCATTAACGAGCAATTTCCAAGACTGCACTGGTTATCATGTTTTGCTACGGTGGTGGACACTGAAAACTCGAGAAAACCGTGGGGCCACACCAGTTCTTTGGGTGATGATTTTTCAAAGAAAGTCATATGCAATACATTTGGGTATAACTAAATAGGTAAGTTTCAATGAGGCGAGTTCAGAATGAACAGTGATGATCTCCTTTCTCCATAACTATACTATACGTCCCTTTTATTTACTGTAGTTTTTAAGAACAAATTCTCTGATGAACCAGTCGTGAAACCGTATATCGTTTTCTGCCAATTCCGGATGAAATGATGTCGCAAGAATATTGTTTTTTTGCTTAGCGGCAACAATTAGTTCTTGACCACCATTATCCTTCCCATCTAATTTGTACAGGACCTGCACATGTTCAGGATCCAGCACCTCTTCTATTACTGGGGCTCTTATAAAAGTAGCAGGAAAATCATTGCAGTGAGGAATAAAGTTTG
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11001:TGAATAACTTTTTTTTTTTTTTGTAGCTGAATGATGAAAGATGGCTCAACTATTCTTACAGTTTCCAATAAAGTGACGCGCCGCCCAATGGCATAACAGTAGTAGGCACATTATATCGTTTGAATGGCAAAATGTTGTGGCAAGGAAAGAGCAGAATTATTTGTTCATGTGGAATGAATTTCACACACACACACACACATATATAAAACTAGTATGTTTCTCCACCATAGTCACATTATTATTCGACCCTTCTGGGAAAGGAACTATAATAGAAAAATAAGTATATCGTAAAAAAGACAAAAATGTCAGAATTCAAGGTTAAAACTGGGCTTGCCCAAATGTTAAAGGGCGGTGTGATTATGGACGTCGTCACACCTGAACAGGCTATTATCGCAGAAAGAGCGGGCGCTTGTGCTGTAATGGCATTGGAACGCATTCCAGCTGACATGCGCAAGTCTGGCCAAGTATGCCGTATGTCAGATCCTCGCATGATCAAAGAA
11501:ATTATGGAAGCTGTTTCAATTCCGGTGATGGCAAAGGTCCGTATTGGACACTTCGTGGAGGCACAGATCCTGGAAGAGCTGCAAGTAGACTACATTGACGAAAGTGAGGTTTTGACTCCAGCTGATTGGACACATCACATTGAGAAGCATAACTTCAAGGTGCCATTTGTTTGCGGTGCCAAGGATCTAGGTGAGGCTTTGAGAAGAATAAACGAAGGTGCTGCAATGATCCGTACCAAAGGTGAAGCAGGTACCGGTGACGTTTCCGAGGCCGTCAAGCACATCACCAAGATTAAGGCGGAGATCCAGCAGTATAAAGAGAATTTGAAGACCGAATCCGATTTTGCAGCTAAGGCCACAGAATTACGCGTCCCTGTCGACTTGCTGAAGACAACACTATCAGAGGGAAAGCTACCTGTAGTCAATTTTGCTGCTGGTGGAGTTGCTACTCCAGCAGACGCTGCTCTATTGATGCAATTGGGTTGTGAAGGTGTTTTCGT
12001:CGGCTCAGGTATATTCAAATCGTCAGATCCTGAGAAGTTAGCATGTGCTATCGTTGAAGCCACGACTCACTACGATAACCCAGCAAAACTATTGCAAGTTTCCAGCGATTTGGGTGACTTGATGGGTGGTATTTCCATCCAATCAATTAATGAAGCAGGAGGCAAAAACGGTGCAAGACTTTCTGAAATCGGATGGTAGAACTAGCGATGCTCACACAACGCTAATTTGTTTCCTTCGAAGGGGCAGTCGGCTATTGTAGTTTCTATATATTATGTAGCACAACATGGAAACCATATTCAGCCAGTTTGTATATATGAGAATTAAACGTTAAAACTTTTTCATCCTATCAGTCTTTCACATTGGCCTTGCCTAAAGGGCACAATCGTTCACGTATATACATATGTATGTTTACGTATATATATATGTGTTTACAAATATGCATGTATATTCTTTTCGAGGAAGATTATTATATGCTATTAGGCGATGAGTCGGCTTAATT
12501:TTTTAGGGGGACGAGATTGGCGCGTTAGTGCATAAAGACAGCAAATCACCTGGAGGTGACAACATTAATGCATTTATCGGTTTTTGGCTATGATGCAATGAGTACAGTTCCAATTGAACGGCTCATGAACTATGAAATATACGAATTATTCAACTAGCAGAAGGCTTGAAATATTACTTATTCAGATTATGAAAATGGTGCTGTTATAGCAAAATAAGCAACATCAATCTCTTGCGACGACAGCAAACAAAACATATAAAAACCTCGTATTATCATCTTCATGAACAATATTCTTGTCCATTCTTTTGTTCTTTTACCTTTTCAATTTTATAAAAATACCACAACAACAATAAACACACTTCCAAGCTATGTCTACAGACAAGATCACATTTTTGTTGAACTGGCAACCAACCCCATACCATATTCCAATTTTCTTGGCTCAAACCAAAGGTTACTTCAAGGAGCAAGGTCTAGACATGGCCATCCTAGAACCAACCAAT
13001:CCTTCCGATGTCACTGAGTTAATTGGATCTGGTAAGGTCGACATGGGTTTGAAAGCCATGATCCACACCTTGGCTGCCAAGGCCCGTGGTTTCCCAGTGACCTCTGTTGCCTCTTTGTTGGACGAACCATTTACCGGTGTCTTGTACTTAAAGGGCAGTGGTATCACTGAAGACTTCCAGTCCCTAAAGGGTAAGAAGATCGGTTACGTTGGTGAATTCGGTAAGATCCAAATCGATGAATTGACCAAGCACTACGGTATGAAGCCAGAAGACTACACCGCCGTCAGATGTGGTATGAATGTCGCCAAGTACATCATCGAAGGTAAGATTGATGCCGGTATTGGTATCGAATGTATGCAACAAGTCGAATTGGAAGAGTACTTGGCCAAGCAAGGCAGACCAGCTTCTGATGCTAAAATGTTGAGAATTGACAAGTTGGCTTGCTTGGGTTGCTGTTGCTTCTGTACCGTTCTTTACATCTGCAACGATGAATTTTTGAA
13501:GAAGAACCCTGAAAAGGTCAGAAAGTTCTTGAAAGCCATCAAGAAGGCAACCGACTACGTTCTAGCCGACCCTGTGAAGGCTTGGAAAGAATACATCGACTTCAAGCCTCAATTGAACAACGATCTATCCTACAAGCAATACCAAAGATGTTACGCTTACTTCTCTTCATCTTTGTACAATGTTCACCGTGACTGGAAGAAGGTTACCGGTTACGGTAAGAGATTAGCCATCTTGCCACCAGACTATGTCTCGAACTACACTAATGAATACTTGTCCTGGCCAGAACCAGAAGAGGTTTCTGATCCTTTGGAAGCTCAAAGATTGATGGCTATTCATCAAGAAAAATGCAGACAGGAAGGTACTTTCAAGAGATTGGCTCTTCCAGCTTAAACGCACTTCGTCACTCCTCGAGCGCAGCCTTCCTCTACGACTTGTGTATGATTTCACATTAGGTTTTTTTTCCTCCCTGATATTTAGATATTTACTATTAAGATATTAT
14001:TTATGAGCCTTTTATTACAGCTTCTTTTCCCTTGTAATTATTGTACTTGCCTCCAAGTATCGAAAGTCTTGCGTTGCCTCAATTTGCCACTTCAAATACTGTAATCTGCACAATTTACGTCCGAAATAGATGAGGGATAAAAGCTGTTTTTAAGTACGGCTTATTCAAAAGTATAAAAGTAGAGAGCATAGAATATATAAGGGCATATTTCTTACACAAACGCACCAAAAAAAAAAAAATCTGATTAATCGAAGGAAATCTGCGCAGACATTGCCGTGAGAAGTGAAGCCTTCTTGGTAACAGCCGGATCATCACCGATAAAATTAGTAGGAAAACCAACATCAAAAGGAATAATACTTTCTAAGTACTTTATTTGTTCTGGTGTTAATTTAATGCTCAAAGCCTCAATGTTCTGTTTGAGGTGTTCAATTTTCCTTCCTCCAACCAATGGAAAAACATTTTTCGCCTTAGAGCGAACATAGGCAATAGCAATAGCAGTA
14501:ACAGATTCAGTGCCATGTTCCTCAGCAACCTTGGCCAATGCTTCACTAATCTTGATTTCTGCATCTGTTTGTTCAGAGGCGCCAACGAAAGAACGAATACCCTCTCCATTCTTCCTCCGTTCCTCCATTGCTTTTTTACTCTGAAATCTTCCACCTCCCATGACATCCCATGGGGCGAGGGCCATACCGAAATGCCTAGCCATTGGAATGATATCACGTTCGAAGTCTCTGTTCAACAGGTTCCATTTACCTTGATAGATGCTAAAAGGGGTTTTACCATGAGATTTAGCGTAGTAATTTGCCGCAGAAACAACCCAGGCAGGCGTATCAGACACACCCAAATAGAGGACCTTGCCTGCTGCACTAGAATGTGTAAACTATCCATAACTTCTTCGATAGAACTCATATAATCCCACCAGTGAACGTAAAGTATATCAATCCAATCAGTTTGCAATTTGCGGAGAGAATCCCTCACACTCACATGCAAACTACGCTTGTGA
15001:TTGCCACAGTAGTTTGCGCTTTTACCACCACCAACGTCGTATTTCTTATAGTCAGTGGTAAACTTGGTGGCGATTACAATCTGGTCGCGTAATTTTCTTGAAACCATCCATTCACCGATCCAAGCTTCTGACTGTTCGTTTTGATAATTATTTGCAGTATCAATGAAATTTCCACCTGCCTCATAAAAAGCATCGAGCAACTCAAAAGCTCGCTCCTTGCTCATTGATCCTAGGATTTCAGACCAAGCGTCGCCAATTGACATTCCTCCCAAAATGAGAGGGGAAACTCTAATACCAGCACTTTTAGAAAGAACTCTGAGACGTCCTAACTCTGTAGATGGTTCAGGAGCAGGAGCAAATAAATCAGCCATATTAAAAATCGCTATTGAAAATGATATAGAAGAGATATTCAGTTAGTACTGAATTTATATCGATTGATTGACTGATTTAGGTTGAACAGAGAGGAAATTGTTTCTCATTGCGACGGTATTGCTCCTTTT
15501:ATATGTCTGAAGATTGAGTGCTTATTTTCTCGAATTTGTGCACGTGAAAACGGTGAACGTGGTTGTATACCTTCGATACGGATTTGCTTACTAATTGAGAGCAAAATTAGTAAGCGAAATGTGAAAATTGGCTTACGAATTAGCCACTGCATGTTCTACGGTTTCCACAACAAAACTGCAAGAACCTGTGTTGATTCGGAACGGTACTATCTCTTCGTAATATCAAAGTTCATTTTGCGTTACTCCATCCTAGTAATTCTTTCAGATTCCATTTGAAAAGGCTAAAGATTCTATAGGAGCGGTGGCAAACCAGAAAGTCTAAATATTGTTATCAATCCGTGCGTTGTTTTGCTTTTTAAAACCAGCAAGGCAAGCAGATGCAATATAGATCTTTACGGCTTCCTGTACGCACATTTTAAACTCGACAAGCCAGCTCCTTCTCCTGTTCACGCCCTCTACGAACCATGTGATTATTAGCACTGTATTTGAGAACAGGTCGG
16001:TGTATCATTTTCTACAATTTTGTACATAGAAAATTAAATGCCGGATGATTGCGATTATCAATTACTTAGCCCTTGATTAAAGTCACGCTTTCACCAAATATGTGCTCCTGCGCACTTCTTTTCTGCCATCTTTTTTTTATTATTTTTTATTGATTCCCACATAGAATCCTTTTCATTAACAATGTGAAACCAAAGAAGAGTAGTAGGTTCACGTTATGTCTCTCTTTAGCATATGTCTCTCTTTAGCATCGCCAAAATATGATTTCAAAATCCTTGAGCCTATTATACCACGTTCCAAAACTTGGCCAAAACAATGCTACAAAAAGCGATGGACTTAATGCTATAGGAGTCTGGTTACTGGCTGCAAGTGAATTCTTCACCCAACTAAGCAGCTTTCTATTAGAAAATATGTTTATATAGGTCTAAACCGTCATACTATTAGTGCTGGCTTGAAGGATGGTATTATTATTTGTCAGGTGTTTTTCTTAACCTACGAAAAC
16501:CAAAGAAGCCTCAGTTTTTTTTTTCCTCCTTTGATCCGAATCGAGTAGGAGTACTTAACGAGTTGAAAAGTTTTCAATTCCTTGTTACCAAAGGACACATTCTAACAAAGCAAAAGTCCTCATACAGACTTGACGGGATATTTCTTTCTATATAAAAACTTCTCAAAAAGTTTTTTACCACAACTGTGGCAATGTTAACGCTTTTTGTCGAAGTAGTGTAGCGTAGCGCCACACTATTCAAGGATACATAGTAAATCAGAGAAAGGTTATCTTGTAAGCATACATATTACTGGAGATCATGTTTCCGGAGTAACTCCGCTGGTATTTCTACTAAGCTGGATCGTTACTATATAATTGATGGATTCTGCTAATAGATTCCACTCTTTTTGTCAGTTCTCCCCTCATTGCTCTGAAAATATACAAGATTTCAGCAATCCTCGCTAATGGCAGTCCTTAACTTGAAACGTGAAACTGTCGACATTGAAGAGACAGCGAAGAAA
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